През 1217г. се завръща в България,за да претендира за бащиния престол!  Оглавява руски наемници с което се започва дълга гражданска война! Борил се затваря в Търново, а Иван Асен обсажда 7 месеца столицата! Градът е превзет, Борил свален и ослепен, а Иван Асен се възкачва на трона и е коронясан около март-април 1218г.

В началото на управлението си той прекратява продължителния сепаратизъм обхванал държавата по времето на Борил! Централизира властта, болярите се обединяват около фигурата на младият Асен! Спрени са всички войни, което се отразява много добре на икономиката, културата и просперитета в царството! Гоненията спрямо богомилите са прекратени! Сключва мир с Унгария и се жени за Анна-Мария, дъщеря на крал Андраш II ! Иван Асен II всъщност в последствие става известен с династическите си миролюбиви бракове. Заради брака България си връща Белградската и Браничевската област. Поддържа мирна политика със Сърбия,
Латинската империя и Епирското деспотство!

Създаването на Латинската империя и раздробяването на Византия на няколко отделни държавици, които претендират за наследници на василевсите включително Епирското деспотство е люта рана за Балканите! При Теодор Комнин Епирското деспотство е в прогрес! Първоначално сключва съюз с Иван Асен II, подсигурявайки тила си и тръгва на война с латините.

Никея също претендира за наследството Византия и се включва в борбата против латините! Цар Иван Асен II е бдителен през това време! 
Вместо Никейци и Епирци да се обединят срещу латините обаче, настъпва разрив в отношенията им, което води до конфронтация помежду им! Теодор Комнин няма силите да превземе Константинопол! 
По това време България на Иван Асен II е със засилени позиции в региона и се намесва активно във вътрешните дела на Латинската империя, като плановете на Асен II е да омъжи дъщеря си за малолетния Балдуин II и да стане негов опекун! ( Същите стремежи и желания както тези на цар Симеон Велики - 330г.по-рано ). Тези събития не отбягват от погледа на Комнин и той вероломно нарушава мирния договор с Иван Асен и напада България! 
Цар Иван Асен II, пресреща противника в наличните си войски и набучва мирния договор на копието си! 

Битката при Клокотница на 9.03.1230г.е паметна дата за управлението на Иван Асен II ! Войските на Теодор Комнин са напълно разгромени и обкръжени, хиляди са пленени, Комнин заедно със семейството си и много висши аристократи са пленени и и отведени в Търново! Поражението на Теодор Комнин има съкрушителен ефект върху държавата му! Българите напредват във всички направления като много крепости се предават без бой! Така само с една битка България отново се разширява на 3 морета и остава господар на Балканите и 3-те морета за следващите над 10г.

Иван Асен II постъпва необичайно хуманно за епохата, като освобождава повечето от пленените войници„ и ги отпратил по селата и градовете им“. Действията му подсигуряват подкрепата на местната аристокрация, но вкарва българска администрация и църковен клир!Голямата българска победа е ознаменувана с възпоменателен надпис върху паметна мраморна колона, поставена в църквата Св. Четиридесет мъченици в Търново!

През 1232/33г.се води война с Унгария, заради съюзът м/у България и Никея,насочен срещу Латинската империя! Братът на Иван Асен - Александър отбива първоначалните атаки, но се стига до кратко превземане на Олтения! След 1230г. Латините сериозно започват да се страхувате от България с което настъпва и разрив в отношенията им!

Владетелят на Никейската империя Йоан III Дука Ватаци решава да търси съюз с българите, за борбата му с латинците. Към такъв съюз се стреми и Иван Асен II. Преговорите завършват успешно и през 1235г. в гр.Галиполи между двамата е сключен договор, скрепен с брак между дъщерята на Иван Асен II Елена и сина на Ватаций - Теодор II Ласкарис. Самият договор довежда и до това ,че Българската патриаршия е възстановена ,заедно и с титула "патриарх" ,което е огромен пробив в дипломацията на Иван Асен II. Българската църква отново е независима! Същата година се започва и война с Латините! Като тя върви успешно за съюзниците, като се присъединяват: Солунският владетел Мануил Комнин Дука, епирският деспот Михаил II Комнин и кумански отряди. България присъединява още територии на база съюзното споразумение! През 1235-36г. неуспешно е обсаден Константинопол.Владетеля на Ахея, пристига на помощ на Латините  Настъпилата зима,също отказва съюзниците от обсадата!

Скоро след това Иван Асен II променя политиката си,прекъсва съюза си с Йоан III Дука Ватаци, сближава се с латинците и повеждат обща борба за прокуждане на никейците от Тракия. Царят е подтикнат към тези си действия под заплахата от готвения с благословията на папата кръстоносен поход за спасяване на Латинската империя,както и от опасността от татарско нашествие!
През 1237г. той отново променя коренно политиката си след " Божие наказание" според него ,което се случва, заради нарушения договор с Никея! В Търново от чумата умират жена му, малкият му син Петър и патриарха! Изоставя обсадата на Цурулон и се връща в столицата!
А по това време надвисва нова опасност наречена - монголите! В близко бъдеще, те ще се превърнат в истински "бич" за Балканите и Европа!
Иван Асен II се помирява с никейците, но запазва добрите си отношения с латинците. 
Жени се за Ирина Комнина дъщеря на епирския деспот Теодор Комнин!
Не се противопоставя на войските на кръстоносния поход на папата организиран срещу Никея през 1239г. 
В началото на 1241г. побеждава един отряд на монголите на Хан Бату, а скоро след това на 24.06.1241г. цар Иван Асен II умира, на около 51г.
23 годишното управление на Иван Асен II, превръща България в първостепенна сила на Балканите и една от най - силните държави в Европа! Културния възход е забележителен - строи църкви ,украсява ги, дарява щедро манастири, по негово време се възстановява монетосеченето! 
Сече монети със своя лик и титла! Дубровнишката грамота пък също ни изяснява величието на България под скиптъра му! Тя е и даваща право на дубровнишките търговци за свободна търговия в земите на Българското царство! 
Смъртта му ,довежда България до поредна дестабилизация! Отново се започват борби за власт,сепаратизъм, бунтове,въстания,сепаративни мирни спогодби,нашествия на татарите - период продължил близо половин век! България никога повече не достига такова величие както при Цар Иван Асен II !